Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms