Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms