Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms