Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ZNF548Q8NEK5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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