Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPC24Q8NBT2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms