Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms