Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms