Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C15orf54Q8N8G6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf54Q8N8G6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms