Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVOPQ8N4V2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms