Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf53Q8N3J3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms