Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED8Q8IZ13 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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