Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FMNL3Q8IVF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FMNL3Q8IVF7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms