Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms