Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RSPH3Q86UC2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPH3Q86UC2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms