Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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