Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms