Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDPD3Q7L5L3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms