Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM47EQ6ZV65 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms