Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEND4Q6ZU67 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms