Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms