Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCL17Q6UXB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCL17Q6UXB2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms