Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms