Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms