Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms