Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms