Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms