Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms