Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DUPD1Q68J44 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms