Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1DP3Q658K8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms