Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOCADQ5VW36 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms