Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms