Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT2Q5VUG0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms