Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf53Q5VUE5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms