Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms