Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms