Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MEX3CQ5U5Q3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEX3CQ5U5Q3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms