Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms