Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH8Q5T0T0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms