Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms