Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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COL5A1-AS1Q5SY13 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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COL5A1-AS1Q5SY13 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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