Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CEP170Q5SW79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms