Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP188Q5SRE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms