Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC158Q5M9N0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms