Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms