Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRDTQ58F21 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms