Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP55Q53EZ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms