Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms