Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf22Q49AR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf22Q49AR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms