Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP24-1Q3LI83 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP24-1Q3LI83 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms