Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HFEQ30201 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HFEQ30201 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HFEQ30201 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HFEQ30201 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HFEQ30201 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms